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新疆工程学院是自治区区属普通本科高校，是国家首批百所应用型试点高校，学校坐落于新疆首府-美丽的乌鲁木齐。 学校因煤而建，因工而兴，是一所传承红色基因赓续优良传统的学校。1958年，中国人民解放军总后方勤务部第二预备学校163名官兵集体转业到新疆，组建了乌鲁木齐煤矿学校。1985年更名为新疆煤炭专科学校，1994年更名为新疆工业高等专科学校，2012年经教育部批准升格为新疆工程学院。60多年来，学校秉承“艰苦奋斗，扎根边疆，自强不息，甘于奉献”的胡杨精神和“艰苦奋斗，无私奉献，求真务实，负重致远”的“矿山魂”精神，培植了“知行统一，追求卓越”的校训，逐渐发展成为了一所以工为主、煤炭和能源特色鲜明的应用型大学。近年来，学校党委提出了“强党建、保稳定、抓改革、促转型、谋发展、创一流”的工作思路，遵循“五个坚持”、抓好“五个机遇”、提升“五个竞争力”、弘扬“五种精神”、做好“五个服务”，朝着三个“五年目标”团结奋斗，加快推进特色鲜明高水平应用型大学建设。
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喀什大学位于“一带一路”重要节点、中巴经济走廊起点、南疆城市群区域中心—喀什市，是中国最西部的大学、欧亚大陆腹地口岸边境上的大学、“一带一路”重要节点上的大学、“棋眼”中心的大学。 学校始建于1962年，前身为喀什师范专科学校。1978年升格为喀什师范学院，2003年获得硕士学位授予资格，2015年更名为喀什大学，2016年被确定为全国100所转型发展试点高校之一。1994年、2009年先后两次被国务院授予“全国民族团结进步模范集体”光荣称号，2014年中国语系被国务院授予“全国民族团结进步模范集体”光荣称号，2022年被评为“自治区民族团结进步示范学校”。2024年获批博士学位授予单位。
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伊犁师范大学位于“塞外江南”——伊犁，是教育部、江苏省人民政府与新疆维吾尔自治区人民政府共建高校。长期以来，学校全面贯彻党的教育方针，坚持“用胡杨精神育人、为兴疆固边服务”，扎根边疆77载为社会培养了近13万名政治可靠、专业过硬、扎根边疆、甘于奉献的各民族优秀人才，充分发挥了戍边固边、稳边安边的历史作用，为新疆特别是伊犁州的教育发展、经济繁荣、社会稳定、民族团结提供了智力支撑和人才保障，尤其是为边疆基础教育事业发展作出了极为重要的贡献，被誉为“天山脚下人才摇篮 伊犁河畔教育名校”。先后涌现出了全国民族团结先进个人阿孜也夫、全国五一劳动奖章获得者和全国优秀教育工作者泰来提、全国优秀教师居努斯汗、全国优秀教师易延坚、全国模范教师汤建钢等模范人物，尹志礼、黄以能等扎根边疆、奉献边疆的优秀教师。学校曾荣获“全国五四红旗团委”“全国扶残助残先进集体”“全国绿化模范单位”“自治区民族团结先进集体”“自治区党建工作示范高校”等荣誉称号。
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新疆工业学院是经教育部批准、由新疆生产建设兵团举办的一所公办全日制普通本科院校。2024年12月31日，教育部党组会议审议通过学校设置方案。2025年2月21日，教育部正式批复设立新疆工业学院。在教育部的统筹指导与持续支持下，以中南大学为组长单位的31所高水平高校实施“组团式”对口支援，构建起“大组团+小组团+专业包建”相结合的全方位支援新模式，在校园规划、师资队伍、专业设置与课程体系建设等方面提供系统性帮扶，协助完成学科专业发展规划、人才培养方案等关键任务，为学校实现高起点开局、高质量建设与跨越式发展注入强大动能。
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石河子大学
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塔里木大学
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新疆农业大学
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新疆师范大学
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新疆艺术学院
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新疆教育学院
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新疆农业大学科学技术学院
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新疆农业职业技术学院
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新疆石河子职业技术学院
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新疆大学始终秉承“团结、紧张、质朴、活泼”的校训，坚守“开拓、进取、求实、创新”的优良校风，坚持“立足新疆、服务西部、面向全国、辐射中亚”的办学定位，坚持“以抗大精神育人，为兴疆固边服务”的办学特色，坚持“建强工科、优化理科、繁荣文科、促进交叉”的学科建设理念和办学优势，力争到2035年全面建成“丝绸之路经济带上特色鲜明的研究型一流大学，成为传承红色基因的精神家园、区域重要的人才中心和创新高地”。
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喀什师范学院
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新疆财经大学
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昌吉职业技术学院
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昌吉学院
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新疆医科大学
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新疆天山职业技术学院